การสูญเสีย (Loss in the system) ในระบบโซลาร์เซลล์ มีผลทำให้พลังงานไฟฟ้าที่ได้ออกมาน้อยกว่าค่ารังสีอาทิตย์ที่ตกกระทบแผงโซลาร์เซลล์ ซึ่งอาจเกิดได้จากหลายสาเหตุ ดังนี้

1. อุณหภูมิที่เพิ่มขึ้นที่แผงโซลาร์เซลล์ มีผลทำให้พลังงานที่ได้ลดลง
2. ฝุ่นและสิ่งสกปรกที่อยู่บนแผงโซลาร์เซลล์ ทำให้ประสิทธิภาพในการผลิตพลังงานลดลง
3. ประสิทธิภาพของอินเวอร์เตอร์ในการแปลงกระแสไฟจากกระแสตรงเป็นกระแสสลับ มีผลต่อพลังงานที่ผลิตได้